Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Papd7Q6PB75 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms