Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AtminQ6P9S1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms