Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Podnl1Q6P3Y9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms