Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Soga3Q6NZL0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Soga3Q6NZL0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Soga3Q6NZL0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Soga3Q6NZL0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Soga3Q6NZL0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Soga3Q6NZL0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms