Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc3bQ6NWW9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms