Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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