Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms