Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Carmil1Q6EDY6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms