Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms