Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms