Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Pdzrn3Q69ZS0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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