Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp9bQ66X22 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrp9bQ66X22 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms