Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ino80dQ66JY2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ino80dQ66JY2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ino80dQ66JY2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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