Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms