Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt12Q64291 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt12Q64291 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms