Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms