Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms