Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf260Q62513 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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