Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtmQ62388 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AtmQ62388 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AtmQ62388 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtmQ62388 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtmQ62388 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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