Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp1Q62209 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms