Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dsg1aQ61495 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms