Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf4bQ61136 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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