Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sim1Q61045 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sim1Q61045 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms