Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Traf3Q60803 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms