Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samhd1Q60710 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms