Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SkiQ60698 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SkiQ60698 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SkiQ60698 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms