Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms