Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HnrnpdQ60668 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpdQ60668 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms