Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a3Q5XF89 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms