Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsr1Q5SWD9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsr1Q5SWD9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms