Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc42Q5SV66 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms