Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd40Q5SUE8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms