Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d1Q5SSN7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms