Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85aQ5SP85 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms