Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf1Q5ND28 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms