Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim41Q5NCC3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim41Q5NCC3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 489.6 ms