Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm3Q5F4S9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms