Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nlrc3Q5DU56 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms