Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Rtl5Q5DTT4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtl5Q5DTT4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms