Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn3Q499D0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn3Q499D0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms