Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms