Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Lrrc43Q3V0L5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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