Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
4930596D02RikQ3V0H9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms