Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn13Q3UW68 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms