Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B230104I21RikQ3USW4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B230104I21RikQ3USW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms