Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm6899Q3USS0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm6899Q3USS0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm6899Q3USS0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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