Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm28047Q3US59 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms