Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms