Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp30Q3UN04 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp30Q3UN04 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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