Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cog7Q3UM29 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms